Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms