Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms