Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pfdn6Q03958 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn6Q03958 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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