Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms