Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tff2Q03404 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms