Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms