Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms