Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Itga4Q00651 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms