Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
rp9P97762 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
rp9P97762 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
rp9P97762 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
rp9P97762 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms