Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnikP83510 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnikP83510 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnikP83510 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms