Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms