Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx1P81068 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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