Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms