Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms