Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tuba4aP68368 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms