Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms