Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms