Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2mP61082 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms