Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ube2d3P61079 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms