Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms