Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms