Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms