Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms