Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms