Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pex2P55098 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pex2P55098 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pex2P55098 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms