Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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