Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpaP53566 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms