Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtshP49935 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtshP49935 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtshP49935 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtshP49935 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms