Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpreP49446 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpreP49446 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms