Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms