Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms