Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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