Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms