Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms