Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms