Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx1P41778 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx1P41778 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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