Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VhlP40338 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VhlP40338 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms