Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms