Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms