Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms