Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd22P35329 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd22P35329 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms