Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms