Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms