Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms