Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrgP28705 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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