Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NapbP28663 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NapbP28663 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NapbP28663 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms