Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col2a1P28481 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms