Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms