Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms