Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms